系列课程：

菌群多样性、代谢组、宏基因组、全基因组

检测内容：

16SrDNA是细菌的系统分类研究中最有用的和最常用的分子钟，其进化具有良好的时钟性质，在结构与功能上具有高度的保守性，素有“细菌化石”之称。

16S rRNA基因测序: 16S rRNA基因为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列，主要进行细菌或古菌的多样性分析。

16S与原核微生物分析 —16S序列分析

实验方法：

检测平台：二代高通量平台：Illumina平台；

目前的三大数据库：Silva（v119）、RDP、GreenGene。

常用的是Silva数据库，包含原核、真核、古菌的信息，是目前最全面的数据库，库中共53万多个参考序列。（目前最新的Silva v123中有59万条参考序列，较silva v119增加了6万多参考序列）

实验和数据分析流程

结果展示：

多元分析组图：

送样要求：

送样时请尽量使用冰盒（泡沫盒+干冰+冰袋），以保证运输过程中的低温条件（干冰的挥发消耗量约为3公斤/天）。在打包时先放入足量的干冰，之后用冰袋填充泡沫盒中间的空隙，为了保持冰盒中的低温环境，建议采用厚一点的泡沫盒。

若无法实现低温保存，可以采用格微生物科技（上海）有限公司研发的微生物DNA常温保存液，可以实现微生物样本的常温保存和运输。

取样建议：

保存条件（二选一）

1、-80冰箱冻存；

2、采购上海格微生物 采集保存套装，可常温保存15天

生物学重复：

人体粪便样本，每组不低于30例为宜

文献参考：

需要注意的是，相同引物对微生物类型存在不同偏好，在实验前需要确定是不是有特别关注的物种，通用引物对也是具有一定局限性的