菌群多样性检测
简介:
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。
16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域,通过检测目标区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。 菌标检测提供快速标准化检测。
检测项目:
16S rRNA基因测序: 16S rRNA基因为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,主要进行细菌或古菌的多样性分析。
18S rRNA基因测序: 18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,反映样品中真核生物之间的种类差异。
ITS测序: 该类测序主要对微生物中的真菌多样性进行分析。
二代高通量平台:Illumina平台;
实验流程

检测周期:20个工作日
送样要求:
送样时请尽量使用冰盒(泡沫盒+干冰+冰袋),以保证运输过程中的低温条件(干冰的挥发消耗量约为3公斤/天)。在打包时先放入足量的干冰,之后用冰袋填充泡沫盒中间的空隙,为了保持冰盒中的低温环境,建议采用厚一点的泡沫盒。
若无法实现低温保存,可以采用格微生物科技(上海)有限公司研发的微生物DNA常温保存液,可以实现微生物样本的常温保存和运输。
取样建议:
类型 | 样本 | 重量或体积 |
---|---|---|
人体 | 粪便 | 1g |
动物 | 粪便 | 1g,最少0.1g |
保存条件(二选一):
1、-80冰箱冻存;
2、采购上海格微生物 采集保存套装,可常温保存15天
生物学重复:
人体粪便样本,每组不低于30例为宜
小鼠粪便样本,每组不低于6只为宜
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