微生物高通量检测的样品取样参考

样本取样前,针对不同的实验目的,提前做好分组信息,并在此基础上进行组间取样,高通量结果后可根据实际结果进行分组调整。 
在进行高通量检测生物统计学分析时,分组内至少设立3个生物学重复;在代谢组检测中,植物及动物组织样本生物学重复建议8个以上,临床样本的生物学重复建议30个以上。特别需要注意的是,在人体肠道菌群高通量检测时,由于人群中本身存在肠型的差异,在涉及分组信息的课题时(需对组间差异进行比价,例如某种药物对肠道菌群的影响),尽可能选择较多的样本(每组12-30个以上)来进行测试。这样在数据分析时,可以根据初步的聚类结果调整分组分析,从而消除在个体之间观察到的肠道菌群本身有关,而可能与药物疗效本身无关的部分巨大差异。

样品确认单

针对不同的课题或不同项目的样本,使用字母、数字、下划线“_”,组合成容易区分的样本名称,并注明分组信息。收集管上做到标记清晰,例如6和9的编号很容易混淆,尽量在编号下划一个下划线做以说明。

按设计好的取样信息,取样后填写样品确认单,并对样品批次、来源、种类、个数等进行认真核对。

样本要求

1、基因组DNA:样品浓度不低于50 ng/μl,总体积不少于20μl。对于未抽提的基因组DNA,样本量不低于1g。(如土壤、粪便、动物组织、肠道内容物等)

2、水样:2L以上水过滤后的滤膜,若环境中微生物丰富,可适当减少水的体积。

3、分泌物:2-3 mL(唾液、鼻涕、尿液等)

4、皮肤、口腔、生殖道等拭子型样本1-2根。

样品的保存及寄送

样本采集后,使用液氮速冻,并立即放入-80°C冰箱或置于冰盒、干冰上转运至实验室-80°C冻存,防止反复冻融。当实验样本非一次性收集时,已收集样本存放-80°C冰箱内,待当收集完所有样本后, 使用干冰快递至公司。
如果实验室不能满足低温保存运输的条件,推荐使用常温保存液,进行样本的保存运输。
无论采取何种方式取样、运输、保存,同一项目所有样本的采样、运输、保存方式需保持一致。
特殊样本或珍贵样本请提前与工作人员联系,双方确认后方可寄送。请尽量避免在节假日送达,以确保您的样本能及时得到处理。

样本备份

实验中可能会出现种种意外,或者您在样本高通量测序后对其中的一些代谢物比较感兴趣,想要进行其他组学的研究;因此建议在样本量充足的条件下进行分装备份。
 
磨刀不误砍柴工,在实验开始之前详细考虑可能遇到的问题,有助于课题的顺利进行。如您在取样过程中有疑问,欢迎致电咨询。

服务热线:400-992-9598

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